La parte più profonda di un mare o di un oceano non riceve la luce del sole nemmeno durante il giorno. Gli organismi che risiedono nella parte più profonda del mare o dell'oceano hanno per natura il vantaggio della luce nel loro corpo. Questa caratteristica negli animali è chiamata bioluminescenza. Questo li aiuta a predare e talvolta anche a nascondersi dai predatori. Alcuni lo usano anche come noi usiamo una torcia. La sostanza chimica che aiuta a creare questa luminescenza è diversa in ogni organismo. L'Aequorea victoria è una medusa che pone GFP per la bioluminescenza. Per saperne di più su questa proteina, ecco alcune differenze tra GFP e YFP.
GFP contro YFP
La differenza tra GFP e YFP è che la GFP è la principale proteina prodotta nella medusa e la YFP è la versione mutata di YFP. La GFP è una proteina fluorescente verde e la YFP è una proteina fluorescente gialla. Sono anche di colore diverso, uno è verde e l'altro è giallo. La proteina fluorescente gialla ha picchi di emissione e di eccitazione più alti rispetto ai picchi di emissione e di eccitazione della proteina fluorescente verde.
La forma completa di GFP è la proteina fluorescente verde. Si trova in una medusa conosciuta come Aequorea Victoria. La caratteristica principale della GFP è che emette una fluorescenza verde quando esposta a sfocati raggi ultravioletti. Questa proteina è composta da 238 aminoacidi. Ha anche alcune versioni migliorate, che vengono utilizzate principalmente per gli esperimenti. Questi sono usati per produrre nuovi geni nelle cellule e nel campo della biologia molecolare.
La forma completa di YFP è la proteina fluorescente gialla. È la versione attenuata della proteina fluorescente verde trovata in Aequorea Victoria. Questa proteina emette una fluorescenza gialla se esposta ai raggi UV blu. Questo ha tre versioni migliorate. Quelli sono Ypet, Citrine e Venus. Questa proteina viene utilizzata anche per esperimenti su cellule e biologia molecolare.
Tabella di confronto tra GFP e YFP
| Parametri di confronto | GFP | YFP |
| Modulo completo | Proteina Fluorescente Verde | Proteina Fluorescente Gialla |
| Derivato da | Aequorea Victoria che è un tipo di medusa | Il mutante genetico della Green Fluorescent Protein |
| Picco di eccitazione (lunghezza d'onda) | 395 nm | 515 nm |
| Picco di emissione (lunghezza d'onda) | 509 nm | 527 nm |
| Versioni migliorate | smRS-GFP | Ypet, Citrino, Venere |
Cos'è GFP?
La forma completa di GFP è la proteina fluorescente verde. Si trova in una medusa conosciuta come Aequorea Victoria. La caratteristica principale della GFP è che emette una fluorescenza verde quando esposta a sfocati raggi ultravioletti. Questa proteina è composta da 238 aminoacidi. La sua massa molecolare è 27 kD. Ha anche alcune versioni migliorate, che vengono utilizzate principalmente per gli esperimenti.
Questa proteina ha le lunghezze d'onda di fluorescenza del tipo di emissione e del tipo di eccitazione. Il picco di emissione è l'intervallo in cui viene emesso il raggio e il picco di eccitazione è quando i fotoni si eccitano e iniziano a emettere luce. Il picco di eccitazione è 395 nm e il picco di emissione è 515 nm.
La GFP ha importanti applicazioni nelle ricerche sulle cellule e sul molecolare. Questa proteina viene utilizzata come gene reporter dagli scienziati nelle cellule e nel molecolare. Il gene reporter è un tipo di gene che è attaccato a un altro gene che viene utilizzato per l'esperimento in sequenza ed è facilmente identificabile rispetto al gene principale. Questo è usato come gene reporter a causa delle sue caratteristiche di bioluminescenza.
Questa proteina ha anche molti altri vantaggi. Questo gene è ereditario e inoltre non reagisce biologicamente con altri geni. Quindi per le ricerche, questo gene è per lo più preferito.
Cos'è YFP?
La forma completa di YFP è la proteina fluorescente gialla. È la versione attenuata della proteina fluorescente verde trovata in Aequorea Victoria. Questa proteina emette una fluorescenza gialla se esposta ai raggi UV blu. Questo ha tre versioni migliorate. Quelli sono Ypet, Citrine e Venus. Questa proteina viene utilizzata anche per esperimenti di microbiologia.
La proteina fluorescente gialla si forma dopo quattro mutazioni della varietà selvatica di proteina fluorescente verde che si trova nella medusa del mare profondo conosciuta come Aequorea Victoria. I principali e più importanti cambiamenti della mutazione sono la sostituzione della treonina con un'altra sostanza chimica chiamata tirosina nella posizione di 203. Questo cambiamento ha dato vita alla variante YFP. Il picco di eccitazione di YFP è 515 nm e il picco di emissione è 527 nm. Entrambi i picchi sono più alti rispetto al genitore GFP.
Le versioni migliorate di YFP che sono Ypet, Citrine e Venus hanno alcuni vantaggi in più rispetto alla loro proteina madre. Queste sono che queste varianti migliorate hanno una maturazione più rapida, una maggiore luminescenza e una ridotta sensibilità al cloruro rispetto alla YFP madre. L'YFP è utilizzato anche nel campo della biologia cellulare e molecolare. L'YFP viene utilizzato principalmente come accettore per i geni sensori codificati geneticamente. La variante di Venere ha un cambiamento nella nuova sequenza di amminoacidi.
Principali differenze tra GFP e YFP
Conclusione
Queste proteine si trovano principalmente negli animali acquatici che risiedono in profondità sotto gli oceani. Questi sono molto importanti per la loro sopravvivenza. Il GFP e l'YFP sono solo esempi delle sostanze chimiche presenti in una medusa chiamata Aequorea Victoria. Ci sono un numero infinito di sostanze chimiche di questo tipo che si trovano in diversi organismi a seconda del loro bisogno di sopravvivenza.
Al giorno d'oggi, i geni nelle loro proteine vengono utilizzati per ricerche e portano alla nascita di molti nuovi geni dalla combinazione di permutazione con altri geni. Alcuni di questi hanno diversi vantaggi che portano al loro utilizzo nelle aree richieste.
